柴油機車的傳動系統：

NJ2型機車為交—直—交流電傳動柴油機車，采用通用電氣公司的交流傳動系統，包括5GMG207型交流發電機、17KG525型牽引逆變器和5GEB30型牽引電動機。5GMG207型交流發電機為三相同步無刷發電機，額定功率為3000千瓦。17KG525型牽引逆變器采用IGBT為功率控制器件，采取脈寬調制（PWM）和六階梯波方式相結合的控制策略。5GEB30型牽引電動機為三相異步牽引電動機，功率為460千瓦。牽引狀態時，柴油機直接驅動同步牽引發電機發出三相交流電，分別供給3個整流模塊，轉換成中間直流電壓后供給6臺牽引逆變器，再將直流電轉換成頻率、電壓可調節的三相交流電，由微機控制系統分別向2臺轉向架上的6臺三相異步牽引電動機實現軸控式供電，通過傳動齒輪驅動車輪。 

柴油機車的控制系統：

NJ2型機車的運行控制系統采用由通用電氣公司開發的“綜合控制架構”（Consolidated Control Architecture，CCA）系統，與AC6000CW型柴油機車的控制系統大致相同。該系統以3臺智能顯示器作為機車的控制計算機，通過一個串聯的ARCNET局域網通訊網絡，控制機車上所有其他計算機和控制裝置的運行，包括柴油機控制、牽引控制、制動控制、輔助電源控制、重聯控制、粘著控制、故障診斷和檢測等功能。NJ2型機車并裝設了上千個不同功能的傳感器，具有氣壓、溫度、轉速等檢測監控功能，機車各主要部件的運作狀態信息會直接顯示在智能顯示屏上。